Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9I4

Tbc1d20, TBC1 domain family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d20Q9D9I4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbc1d20Q9D9I4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tbc1d20Q9D9I4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms