Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Cntd1Q9D995 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntd1Q9D995 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Cntd1Q9D995 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cntd1Q9D995 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cntd1Q9D995 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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