Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot8Q9D8X5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot8Q9D8X5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms