Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Derl3Q9D8K3 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms