Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl4Q9D8E6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms