Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vstm5Q9D806 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms