Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V1

Sh2d4a, SH2 domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d4aQ9D7V1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sh2d4aQ9D7V1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sh2d4aQ9D7V1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms