Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl40Q9D783 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms