Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nop56Q9D6Z1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nop56Q9D6Z1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nop56Q9D6Z1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nop56Q9D6Z1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nop56Q9D6Z1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nop56Q9D6Z1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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