Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rtl8cQ9D6I0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Rtl8cQ9D6I0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rtl8cQ9D6I0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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