Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gins2Q9D600 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms