Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc39Q9D5Y1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms