Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Syap1Q9D5V6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Syap1Q9D5V6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Syap1Q9D5V6 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Syap1Q9D5V6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Syap1Q9D5V6 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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Syap1Q9D5V6 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syap1Q9D5V6 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms