Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms