Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc130Q9D516 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms