Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
4931428L18RikQ9D4S9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms