Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

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Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt20Q9D312 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms