Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vsig1Q9D2J4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms