Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trappc6bQ9D289 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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