Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q6

Erp44, Endoplasmic reticulum resident protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp44Q9D1Q6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Erp44Q9D1Q6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Erp44Q9D1Q6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms