Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q5

Serpinb3b, MCG21235, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpinb3bQ9D1Q5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Serpinb3bQ9D1Q5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Serpinb3bQ9D1Q5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms