Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lmbr1lQ9D1E5 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms