Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Mrpl28Q9D1B9 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Mrpl28Q9D1B9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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