Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Susd3Q9D176 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Susd3Q9D176 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms