Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc3Q9D114 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc3Q9D114 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms