Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Tmem53Q9D0Z3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Tmem53Q9D0Z3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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