Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc47Q9D024 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc47Q9D024 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms