Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Mrpl55Q9CZ83 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl55Q9CZ83 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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