Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snf8Q9CZ28 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms