Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufs4Q9CXZ1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms