Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Xrcc3Q9CXE6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Xrcc3Q9CXE6 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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