Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXD9

Lrrc17, Leucine-rich repeat-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc17Q9CXD9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Lrrc17Q9CXD9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lrrc17Q9CXD9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms