Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Utp23Q9CX11 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms