Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Khdc3Q9CWU5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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