Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd12Q9CWU0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms