Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
NubplQ9CWD8 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms