Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Otud1Q9CUB6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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