Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rhobtb3Q9CTN4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rhobtb3Q9CTN4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms