Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sft2d3Q9CSV6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sft2d3Q9CSV6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms