Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rprd1bQ9CSU0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms