Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9CRC3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Q9CRC3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms