Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccer1Q9CQL2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Ccer1Q9CQL2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms