Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rdm1Q9CQK3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rdm1Q9CQK3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms