Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Atp6v0e1Q9CQD8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Atp6v0e1Q9CQD8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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