Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Q9CQC3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms