Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Trappc5Q9CQA1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc5Q9CQA1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trappc5Q9CQA1 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms