Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
StambpQ9CQ26 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms