Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp3Q9CQ10 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Chmp3Q9CQ10 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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Chmp3Q9CQ10 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Chmp3Q9CQ10 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp3Q9CQ10 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms