Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR7

Sike1, Suppressor of IKBKE 1, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sike1Q9CPR7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sike1Q9CPR7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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