Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NsmfQ99NF2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms